BACA JUGA:Kendalikan Inflasi, Pj Bupati Rizali Ajak Petani Tanam Bawang Merah, Kentang dan Cabai
Sama halnya dengan tanaman holtikultura lain, tanaman bawang merah tidak lepas dari serangan hama dan penyakit. Hama pada tanaman bawang merah biasanya merusak daun, biji, serta akar.
Beberapa hama yang biasa menyerang bawang merah antara lain; ulat daun, ngengat, dan orong-orong. Penyakit pada tanaman bawang merah dapat disebabkan oleh cendawan seperti penyakit daun lemas, busuk umbi, dan mati pucuk.
Keadaan lingkungan juga dapat memicu penyakit pada bawang merah. Misalnya, kelebihan atau kekurangan unsur hara dalam tanah, pestisida yang kurang cocok, atau suhu yang kurang sesuai. Penggunaan pestisida juga bisa mengendaian hama dan penyakit tanaman bawang merah.